昆明市滇池管理局是为了适应滇池保护和治理的需要，于2002年4月，在昆明市滇池保护委员会办公室基础上组建的。按昆明市人民政府对机构设置的通知规定，昆明市滇池保护委员会办公室（昆明市滇池管理局）既是市滇池保护委员会的常设办事机构，又是市政府主管滇池污染治理与滇池保护和行政执法的职能部门。

    2004年4月23日，成立了滇池管理综合行政执法局，标志着滇池依法保护和管理又迈上新的台阶。